Τα τελικά αποτελέσματα του δημοψηφίσματος έδωσε στη δημοσιότητα, λίγο πριν τις 3 τα ξημερώματα, το υπουργείο Εσωτερικών.
Με την ενσωμάτωση πλέον στο 100%, το ΟΧΙ επικράτησε με ποσοστό 61,31%, έναντι του ΝΑΙ, με ποσοστό 38,69%.
Πορτοκαλί βάφτηκε ο χάρτης της Ελλάδας το βράδυ του δημοψηφίσματος, καθώς το ΟΧΙ επικράτησε και στις 13 περιφέρειες της χώρας. Τα μεγαλύτερα ποσοστά σημειώθηκαν στις περιφέρειες Κρήτης και Ιονίων Νήσων, ενώ το μικρότερο «χάσμα» μεταξύ των δύο επιλογών είναι στην περιφέρεια Πελοποννήσου.
Αναλυτικά τα αποτελέσματα στις περιφέρειες είναι τα ακόλουθα:
Αν. Μακεδονίας – Θράκης ΟΧΙ 60,42% - ΝΑΙ 39,58%
Αττικής ΟΧΙ 59,68% - ΝΑΙ 40,32%
Βορείου Αιγαίου ΟΧΙ 61,30% - ΝΑΙ 38,70%
Δυτικής Ελλάδας ΟΧΙ 64,76% - ΝΑΙ 35,24%
Δυτικής Μακεδονίας ΟΧΙ 60,17% - ΝΑΙ 39,83%
Ηπείρου ΟΧΙ 59,18% - ΝΑΙ 40,82%
Θεσσαλίας ΟΧΙ 62,29% - ΝΑΙ 37,71%
Ιονίων Νήσων ΟΧΙ 67,73% - ΝΑΙ 32,27%
Κεντρικής Μακεδονίας ΟΧΙ 59,91% - ΝΑΙ 40,09%
Κρήτης ΟΧΙ 69,87% - ΝΑΙ 30,13%
Νοτίου Αιγαίου ΟΧΙ 63,95% - ΝΑΙ 36,05%
Πελοποννήσου ΟΧΙ 57,34% - ΝΑΙ 42,66%
Στερεάς Ελλάδας ΟΧΙ 64,27% - ΝΑΙ 35,73%